质粒DNA提取试剂盒使用需严格遵循操作规范,把控菌液培养、裂解、洗涤、洗脱等关键环节。出现故障时,可结合排查要点,从操作步骤、试剂状态、仪器参数等方面逐一排查,快速定位问题并解决,保障实验结果的准确性和可靠性。
最常见故障为DNA产量过低,主要成因包括菌液培养异常、裂解不充分、洗涤残留及洗脱效率低。菌液方面,若培养时间不足或转速过低,菌体浓度不足,需保证37℃、200-220rpm振荡培养12-16小时,避免过度培养导致菌体老化。裂解步骤中,裂解液与中和液比例失衡或混匀不充分,会影响菌体裂解和核酸释放,操作时需严格按说明书配比,温和颠倒混匀,避免剧烈震荡导致基因组DNA污染。洗涤环节若洗涤液未全离心去除,残留乙醇会抑制后续实验,需确保最后一次洗涤后充分离心,倒尽废液并晾干吸附柱。洗脱时,洗脱液体积不足、未预热或静置时间不够,会降低DNA回收率,建议使用50-100μL预热至65℃的洗脱液,滴加后静置2-5分钟再离心。

其次是DNA纯度差,表现为A260/A280比值偏离1.8-2.0范围,多由蛋白质、RNA污染或试剂残留导致。蛋白质污染源于裂解不好或中和不充分,可在裂解后增加离心时间,确保上清液澄清无沉淀;若仍有污染,可在洗脱前用蛋白酶K处理。RNA污染则是RNase失活或未添加,需检查RNase储存条件,使用前确认其活性,必要时在裂解液中额外添加RNaseA。试剂残留多为乙醇或盐离子,可通过增加洗脱前晾干时间、二次洗脱或用TE缓冲液替代水洗脱来解决。
离心后无上清液或吸附柱堵塞也是高频问题,主要因菌体过多、裂解液粘稠或离心参数不当。菌液接种量过大易导致裂解后溶液粘稠,建议按试剂盒要求控制接种量(通常1-5mL)。若离心后无上清,可适当提高离心转速和时间,若吸附柱堵塞,可将上清液过柱前再次离心,去除杂质后再上样。
此外,洗脱后无DNA可能是吸附柱失效或洗脱液pH不适宜。吸附柱需密封冷藏保存,避免受潮失效;洗脱液pH应维持在7.0-8.5,若pH过低会影响DNA与洗脱液结合,可调整缓冲液pH值后重新洗脱。